Nominations des préfets et sous-préfets.
Privilèges accordés à la ville de Haguenau.
Affaires civiles et criminelles de la ville de Haguenau.
Relations de la Préfecture avec la ville d'Obernai.
Charge de prévôt et sous-prévôt de Rosheim ; collonge de l'Evêque de Strasbourg à Rosheim et litige pour glandage avec le fermier de Gutenhausen ; affaires civiles et criminelles.
Relations de la Préfecture avec la ville de Sélestat.
Relations de la Préfecture avec la ville de Kaysersberg.
Relations de la Préfecture avec la ville de Turckheim.
Relations de la Préfecture avec la ville de Colmar.
Relations de la Préfecture avec la ville de Munster.
Mémoire sur Mulhouse et sur la nature des fiefs d'Alsace, présenté par les officiers de l'archiduc Sigismond d'Autriche à Charles le Téméraire, duc de Bourgogne ; affaires d'impositions ; conflits de juridiction entre Mulhouse et les Régences d'Ensisheim et de Brisach, pour envahissement de ban, affaires forestières et de chasse.
Relations de la Préfecture avec les villages de Bischwiller, Bitschhoffen et de Dangolsheim.
Relations de la Préfecture avec les villages d'Erpach, Forstheim, Gunstett, Surbourg, Kuttolsheim, Mommenheim, Morschwiller-le-Bas, Ohlungen, Rottelsheim, Rumersheim, Schwabwiller, Uhlwiller et Wingersheim.
Relations de la Préfecture avec les comtes de Hanau-Lichtenberg.
Relations de la Préfecture avec les comtes de Nassau et les familles de Mullenheim, Linange-Westerbourg, Fleckenstein, Ribeaupierre, Wilsperg, Hanau, Falckenstein et Lichtenberg.
Relations de la Préfecture avec les seigneurs d'Allemagne, au-delà du Rhin et dans le Palatinat.
Relations de la Préfecture avec le magistrat de Strasbourg, avec l'hôpital de Strasbourg et avec la famille de Geroldseck.
Relations de la Préfecture avec la Cour de Rome et avec l'évêché de Strasbourg.
Relations de la Préfecture avec les chapitres de Klingenmünster, de Notre-Dame de Landau, de Seltz, de Surbourg et de l'évêché de Spire.
Relations de la Préfecture avec l'abbaye et le chapitre de Wissembourg entre 1482 et 1628.
Relations de la Préfecture avec la cure de l'église Saint-Georges de Haguenau, la cure de l'hôpital de Haguenau, les couvents des Augustins, des Déchaussés, des Pénitentes et les couvents de Sainte-Marie et de Saint-Guillaume à Haguenau, les pères jésuites à Haguenau, l'abbaye de Schwarzach, l'abbaye de Sturzelbronn, l'abbaye de Sainte-Walpurge et la Chartreuse de Strasbourg.
Relations de la Préfecture avec le chapitre de Saint-Martin et les églises de Colmar et avec l'abbaye de Munster.
Affaires civiles.
Les Juifs de la Préfecture.
Dettes et capitaux affectés sur la Préfecture.
Corvées à faire par les communautés de la Préfecture ; droit de sauf-conduit ; péage de Châtenois ; contributions et impositions ; droit d'hospitalité ; greniers à sel ; droits de succession ; droits d'Umgeld sur les vins ; prix et vente des grains.
Bâtiments publics.
Litiges et plaintes divers relatifs aux forêts de Haguenau et de Mellringen.
Documents isolés entrés de 1921 à 1999
Archives entrées par voie extraordinaire en 1921
Archives entrées par voie extraordinaire en 1940-1944
Archives entrées par voie extraordinaire en 1951
Archives entrées par voie extraordinaire en 1953
Archives entrées par voie extraordinaire en 1954
Archives entrées par voie extraordinaire en 1955
Archives entrées par voie extraordinaire en 1959